Adobe PDF (5.34 MB)
Title Details:
Λειτουργική Ανάλυση της Γονιδιακής Έκφρασης
Authors: Nikolaou, Christoforos
Chouvardas, Panagiotis
Reviewer: Bagkos, Panteleimon
Subject: MEDICINE AND HEALTH SCIENCES, LIFE SCIENCES, BIOLOGICAL SCIENCES > LIFE SCIENCES > TECHNOLOGIES AND APPLICATIONS > BIOINFORMATICS
MATHEMATICS AND COMPUTER SCIENCE > COMPUTER SCIENCE > ALGORITHMS AND COMPLEXITY
MATHEMATICS AND COMPUTER SCIENCE > COMPUTER SCIENCE > INTELLIGENT SYSTEMS > BASIC MACHINE LEARNING
MEDICINE AND HEALTH SCIENCES, LIFE SCIENCES, BIOLOGICAL SCIENCES > LIFE SCIENCES > BIOMATHEMATICS
Keywords:
Bioinformatics
Computational Biology
Biostatistics
Algorithms
Machine Learning
Description:
Abstract:
Το κεφάλαιο αυτό αποτελεί φυσική συνέχεια του αμέσως προηγούμενου, παρουσιάζοντας την ανάλυση πειραμάτων γονιδιακής έκφρασης σε λειτουργικό επίπεδο. Οι βασικές βιολογικές έννοιες του συγκεκριμένου κεφαλαίου περιλαμβάνουν τις διαφόρων τύπων οργανώσεις σημασιολογικής πληροφορίας όπως οι βιολογικές οντολογίες και τα βιολογικά μονοπάτια. Επίκεντρο του κεφαλαίου θα είναι το πραγματικό βιολογικό πρόβλημα να προσδιοριστούν οι διαφορικά ρυθμιζόμενες βιολογικές λειτουργίες από ένα πείραμα γονιδιακής έκφρασης. Αφού εισαχθούν οι βασικές μαθηματικές έννοιες του εμπλουτισμού και των λόγων πιθανοτήτων (odds-ratios) θα περιγραφεί μεθοδολογικά η διαδικασία της λειτουργικής ανάλυσης μέσω της χρήσης της υπεργεωμετρικής κατανομής. Στη συνέχεια θα αναλυθούν οι σημαντικές έννοιες, τόσο για τη λειτουργική ανάλυση όσο και για τη μελέτη της γονιδιακής έκφρασης γενικότερα, του ελέγχου πολλαπλών υποθέσεων και τις σχετικές διορθώσεις των αποτελεσμάτων. Στο τελευταίο μέρος του κεφαλαίου θα παρουσιαστούν οι σημαντικότερες κατηγορίες υπολογιστικών μεθοδολογίων για τη λειτουργική ανάλυση της γονιδιακής έκφρασης.

Στο τέλος του Κεφαλαίου θα πρέπει να μπορείτε:
Να αποκομίσετε από το διαδίκτυο πληροφορίες σχετικά με τις λειτουργίες ενός ή περισσοτέρων γονιδίων.
Να προσδιορίσετε τις λειτουργίες εκείνες που είναι σημαντικότερες για ένα δεδομένο πείραμα μέσω της ανάλυσης των σχετικών επιπέδων έκφρασης των γονιδίων.
Να αξιολογήσετε στατιστικά τα αποτελέσματα μιας λειτουργικής ανάλυσης διενεργώντας έλεγχο πολλαπλών υποθέσεων.
Type: Chapter
Creation Date: 2015
Item Details:
License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/gr
Handle http://hdl.handle.net/11419/1586
Bibliographic Reference: Nikolaou, C., & Chouvardas, P. (2015). Λειτουργική Ανάλυση της Γονιδιακής Έκφρασης [Chapter]. In Nikolaou, C., & Chouvardas, P. 2015. Υπολογιστική βιολογία [Undergraduate textbook]. Kallipos, Open Academic Editions. https://hdl.handle.net/11419/1586
Language: Greek
Is Part of: Υπολογιστική βιολογία
Number of pages 30
Publication Origin: Kallipos, Open Academic Editions